تم انشاء المركز الجامعي سوق أهراس مؤسسة عمومية ذات طابع علمي وثقافي ومهني يتمتع بالشخصية المعنوية والاستقلال المالي،وفق للمرسوم التنفيذي رقم 01-279 المؤرخ في 30 جمادى الثانية عام 1422 الموافق لـ: 30 سبتمبر 2001 و حدد عدد معاهد ب 2:
- معهد العلوم و التكنولوجيا و
- معهد العلوم القانونية
– تم تعديل المرسوم التنفيذي أعلاه بمرسوم تعديلي ومتمم رقم 06-282 المؤرخ في 21 رجب عام 1427 الموافق لـ: 16 أوت 2006 المعدل و المتمم
-حدد عدد المعاهد التي يتكون منها المركز الجامعي سوق أهراس و اختصاصها كمايلي
- معهـد العلوم والتكنولوجيا
- معهـد العلوم القانونية والإدارية
- معهـد الآداب و الغات
- معهـد العلوم الإقتصادية والتجارية وعلوم التسيير
- معهـد علوم الطبيعة والحياة
المرسوم التنفيذي رقم 245/12 المؤرخ في 04 جوان 2012 المتضمن انشاء جامعة سوق اهراس ، وحددت عدد الكليات والمعاهد التي تتكون منها جامعة محمد الشريف مساعدية سوق أهراس كمايــلي:
- كلية العلوم والتكنولوجيا
- كلية علوم الطبيعة والحياة
- كلية الآداب و اللغات
- كلية العلوم الإجتماعية والإنسانية
- كلية العلوم الإقتصادية والتجارية وعلوم التسيير
- كلية الحقوق وعلوم السياسية
- معهـد العلوم الفلاحية و البيطرية
- معهـد علوم وتقنيات النشاطات البدنية والرياضية