Résumé

RESUME
En Algérie, le manque d'informations sur l’antibiorésistance chez les Escherichia coli commensales du microbiote intestinal bovin, nous a incité à mener cette étude pour caractériser les souches E coli productrices de béta-lactamases à spectre étendu.
Un total de 300 souches d’E coli a été isolé à partir de fèces de bovins, élevés dans des fermes des wilaya de l’Est Algérien : Souk Ahras, Tébessa, Oum el Bouaghi et Constantine.
La sensibilité aux antibiotiques est testée par la méthode de diffusion sur
gélose , en utilisant un panel de 13 antibiotiques , la sensibilité à la colistine (CMI) est effectuée par microdilution sur milieu liquide. Des fréquences élevées de résistance sont enregistrées pour l'ampicilline (63.67%) , tétracycline (44.67%) , céphalotine (26.33%) et triméthoprime / sulfaméthoxazole (18.67%) par contre (1%) des isolats sont résistants à la colistine .L’analyse de corésistance révèle que (65/21.67%) des isolats sont résistants à plus de trois antibiotiques et (89/29.67%) des isolats présentant une multirésistance (MDR) .On a isolé 77 phénotypes de résistance différents, Les deux phénotypes les plus fréquents sont AMP(13.33%) et AMP-TE (11%) .
Douze phénotypes différents sont producteurs de ß-lactamases à spectre étendu, tous sont des MDR allant de la résistance à 5 antibiotiques jusqu'à la combinaison de 11.
L’analyse génotypique par PCR des 12 isolats d’E coli productrices de béta-lactamases à spectre étendu, révèle leur appartenance aux groupes phylogéniques A1( 83.33%) et B1(16.66%), 03 souches hébergent le gène blaCTX-M du groupe1 et 12 hébergent le gène blaTEM,
Nous rapportons pour la première fois, la détection d’intégrons de classe 1 et de la séquence qacE-sul1chez 7 isolats, ainsi que la première mise en évidence du gène mcr-1 chez trois isolats et les gènes qnrB et qnrS , respectivement chez trois et deux isolats et ceci a partir de fèces de bovins dans l’Est de l’Algérie.
Six isolats portent le gène tetA et 2 portent le gène tetB, le gène sul1 est détecté chez 9 isolats.
Douze pulsotypes différents sont identifiés par PFGE. 10 gènes de facteurs de virulence ont été identifiés, avec une prédominance des gènes fimH et iutA , et un seul isolat porte le gène stx1 . Trois pathovars sont mis en évidence :STEC(1 isolat), MNEC(2 isolats), et EAggEC(3 isolats).
Ces taux élevés de résistance aux antibiotiques, ainsi que la multitude de gènes de résistance et de facteurs de virulence détectés, démontrent que les souches E coli isolées du microbiote intestinal bovin sont une source potentielle de résistance aux antibiotiques, ce qui souligne l'urgence de mettre en œuvre des mesures pour lutter contre le phénomène d’antibiorésistance afin de contrôler la propagation des bactéries multirésistantes de l’animal à l’homme et à l'environnement.
Mots-clés: résistance aux antibiotiques, BLSE, gènes, facteurs de virulence, PCR, PFGE, bovins, Est algérien, Escherichia coli.

Information

Item Type:	Thesis
Divisions:	» Institut des Sciences Agronomiques et Vétérinaires
ePrint ID:	2269
Date Deposited:	2020-08-17
Further Information:	Google Scholar
URI:	https://www.univ-soukahras.dz/fr/publication/article/2269

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