تم انشاء المركز الجامعي سوق أهراس مؤسسة عمومية ذات طابع علمي وثقافي ومهني يتمتع بالشخصية المعنوية والاستقلال المالي،وفق للمرسوم التنفيذي رقم 01-279 المؤرخ في 30 جمادى الثانية عام 1422 الموافق لـ: 30 سبتمبر 2001 و حدد عدد معاهد ب 2:

• معهد العلوم و التكنولوجيا و
• معهد العلوم القانونية

–  تم تعديل المرسوم التنفيذي أعلاه بمرسوم تعديلي ومتمم رقم 06-282 المؤرخ في 21 رجب عام 1427 الموافق لـ: 16 أوت 2006 المعدل و المتمم

-حدد عدد المعاهد التي يتكون منها المركز الجامعي سوق أهراس و اختصاصها كمايلي

• معهـد العلوم والتكنولوجيا
• معهـد العلوم القانونية والإدارية
• معهـد الآداب و الغات
• معهـد العلوم الإقتصادية والتجارية وعلوم التسيير
• معهـد علوم الطبيعة والحياة

المرسوم التنفيذي رقم 245/12 المؤرخ في 04 جوان 2012 المتضمن انشاء جامعة سوق اهراس ، وحددت عدد الكليات والمعاهد التي تتكون منها جامعة محمد الشريف مساعدية سوق أهراس كمايــلي:

• كلية العلوم والتكنولوجيا
• كلية علوم الطبيعة والحياة
• كلية الآداب و اللغات
• كلية العلوم الإجتماعية والإنسانية
• كلية العلوم الإقتصادية والتجارية وعلوم التسيير
• كلية الحقوق وعلوم السياسية
• معهـد العلوم الفلاحية و البيطرية
• معهـد علوم وتقنيات النشاطات البدنية والرياضية